臥式殺菌鍋可根據不同產品設計水浴式殺菌、蒸氣殺菌、噴淋式殺菌三種方式。溫度、壓力、殺菌時間可分自動控制和手動控制。
水浴式殺菌：
在熱水池內用蒸汽將水溫升至沸騰，啟動水泵用大口徑流量管道把熱水抽到鍋內進行直接殺菌。在熱水達到一定水位時，隨即啟動熱水循環泵，把鍋內熱水進行循環，采用三點出水八點進水的方式，在循環時，為了確保鍋內出水點的均勻，采用了三點串聯式.循環水經水汽交換消音器快速升溫（用此水汽交換消音器，避免在鍋內加溫時，蒸汽和貨物的直接接觸，使部分貨物溫度偏高），再通過鍋內八個進水點（上、下、左、右各兩點），使熱水直接達到殺菌鍋內進行循環.在鍋內熱水進行循環的同時，蒸汽角座閥自動開啟進行鍋內升溫，在即將達到溫度時，通過溫度變送器準確的把鍋內溫度輸送到溫控儀，控制蒸汽角座閥進行溫度調節，此調節閥是根據鍋內溫度的升降進行逐步調節，以防止鍋內到達溫度時，溫度反沖。在達到設定溫度的同時，關閉蒸汽角座閥門，進入產品殺菌階段（不同產品殺菌時間可調）。在到達殺菌時間后，報警器報警，打開出水閥及水泵，把鍋內熱水用水泵輸送到熱水池，下一鍋殺菌時循環使用。
產品進入冷卻階段，開啟水泵，把涼水輸送到鍋內，達到設定水位時停止，隨即打開循環閥門，把鍋內涼水進行循環，使產品溫度均勻下降。如工作時間較長，鍋內涼水降不下溫時，打開溢水閥，把鍋內上部熱水排出，同時其它涼水進入，以達到降溫目的。
鍋內壓力由壓力變送器隨著鍋內壓力的升降，把信號輸送到壓力控制儀，進行鍋內壓力自動條整，使鍋內壓力始終處于在規定的范圍內。如超出，可自動停止；如下降，可自動加壓保護。使鍋內產品處于同等壓力下進行殺菌。
在鍋內達到工藝設定的冷卻溫度后，隨即把鍋內涼水排出，卸掉鍋內壓力，殺菌完畢，操作工人打開連鎖裝置，開啟鍋門取貨。
蒸汽式殺菌：
將殺菌鍋裝上產品后關閉鍋門，設定殺菌溫度、殺菌時間。打開蒸汽角座閥自動開啟進行鍋內升溫，在即將達到溫度時，通過溫度變送器準確的把鍋內溫度輸送到溫控儀，控制蒸汽角座閥進行溫度調節，此調節閥是根據鍋內溫度的升降進行逐步調節，以防止鍋內到達溫度時，溫度反沖。在達到設定溫度的同時，自動關閉蒸汽角座閥門，進入產品殺菌階段（不同產品殺菌時間可調）。殺菌時鍋內低于設定溫度，交座閥門自動打開。溫度升到設定溫度自動關閉，使鍋內始終保持設定溫度。直到殺菌時間結束，殺菌鍋的蒸汽對流設計，使鍋內蒸汽循環殺菌，溫度均勻殺菌。報警器報警。
產品進入冷卻階段，開啟水泵，把涼水輸送到鍋內，達到設定水位時停止，隨即打開循環閥門，把鍋內涼水進行循環，使產品溫度均勻下降。如工作時間較長，鍋內涼水降不下溫時，打開溢水閥，把鍋內上部熱水排出，同時其它涼水進入，以達到降溫目的.
鍋內壓力由壓力變送器隨著鍋內壓力的升降，把信號輸送到壓力控制儀，進行鍋內壓力自動調整，使鍋內壓力始終處于在規定的范圍內。如超出，可自動停止；如下降，可自動加壓保護。使鍋內產品處于同等壓力下進行殺菌。
在鍋內達到工藝設定的冷卻溫度后，隨即把鍋內涼水排出，卸掉鍋內壓力，殺菌完畢，操作工人打開連鎖裝置，開啟鍋門取貨。
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